2013年5月2日，中国科学院规划战略局发布了“2012年中国科学院科学出版基金科技期刊排行榜”，排行榜显示，由中国科学院软件研究所主办的期刊《软件学报》在排行榜中位居第7位(三等)，根据规定，前10名期刊将获得三等基金5万元的择优支持，这是《软件学报》第5次获得此项基金。

科学出版基金是由中国科学院设立，是为了支持优秀科技书刊出版，繁荣科技出版事业。它对国内外学术交流、为科教兴国培养人才、推动科技成果向现实生产力转化、促进科技进步和国民经济建设的发展具有深远的意义和影响。