2008年10月13日，由中国科学院团委、青联主办的“2008年度中科院共青团干部业务培训暨分院青联秘书长工作会”在安徽合肥召开。会上，对2006-2007年度中国科学院“五四红旗团委”进行了表彰，软件所团委获此荣誉称号。此外，软件所团委还获得“院奥运志愿者工作先进单位”荣誉称号。
　　软件所团委表示，今后要在原有工作的基础上，进一步加强自身建设，突出特点，更好地发挥团组织的作用。