纪检监督室负责纪检工作，包括上级纪委及所纪委交办的日常工作；协助开展党风廉政与反腐倡廉建设；负责受理和处置有关纪检方面的检举控告；受理不服党纪政纪处分和其他处理的申诉；受理对党风廉政建设和纪检工作的批评、建议；保障党员的权利；配合有关部门对违法违纪案件的调查处理；信访接待及协调管理；开展纪律教育；出具廉洁自律及科研诚信回复意见；所纪委印章及发文管理等。

监督审计工作，包括上级机关及研究所交办的日常工作；开展内部审计；内控监督检查；组织协调科研诚信建设等。